半岛BOB2020年，面对新冠肺炎疫情大战大考，中大医院党委发出倡议，号召大家同心抗疫，1400多名党员、干部、共青团员主动请缨。医院先后派出以邱海波、黄英姿、杨毅等专家为首的20批共26名抗疫勇士，驰援武汉、黄石、江苏、南京、无锡以及黑龙江、吉林、北京、新疆、辽宁等地，为江苏及国家抗疫作出了重要贡献。中大医院还第一时间组织开展全球抗疫，发挥重症医学、影像医学等高峰学科优势，通过视频交流，分享江苏、中国经验。并将抗疫经验总结成论文，发表在国际重要医学期刊，并被国际顶级期刊引用，为世界抗疫提供了中大智慧和中国力量。在驰援抗疫的同时，作为南京市新冠肺炎定点收治医院，守土有责，全院上下齐心协力，严防死守半岛BOB，一院两区安全运行，实现了患者零死亡、医务人员零感染。
中大医院在疫情防控中的突出表现得到了全社会的一致好评，得到了国家、省委省政府的充分肯定，先后获得了全国三八红旗集体、全国优秀员、全国抗击新冠肺炎疫情先进个人、中国五四青年奖章、江苏省五一劳动奖状等国家级、省市级荣誉五十余项。抗疫英雄邱海波、黄英姿受到省委书记娄勤俭等省领导的亲切接见，杨毅作为全省抗疫先进事迹报告会成员作全省巡回演讲。
抗疫报道在全国产生了巨大影响，中央、省市媒体报道超过3000篇次，其中中央媒体报道200多次。据不完全统计，2020年，中大医院抗疫新媒体报道形成了非凡的影响力，总点击量超过8亿人次半岛BOB。抗疫专题片《越是艰险越向前》《懂得》分别荣获全国卫生健康影像大会、江苏省医院微电影节优秀奖和特别荣誉奖。
中大医院重症医学科作为国内一流学科在此次抗疫中发挥了突出作用。邱海波、杨毅、潘纯、谢剑锋4人担当国家卫健委专家组成员。杨毅担任江苏卫健委新冠肺炎医疗救治专家组副组长、重症医学组长，黄英姿担任江苏援黄石医疗队医疗救治及专家组组长，中大重症医学团队被形象地誉为抗疫“航母舰队”，他们为保障江苏省半岛BOB、全国乃至国际新冠肺炎重症患者的生命安全作出了重大贡献。重症医学科获批江苏省重症医学重点实验室，由重症医学科牵头成功申报为国家重大疫情救治基地，重症医学科综合影响力稳步提升，社会责任进一步彰显。
2020年9月10日，中大医院新院区正式奠基开工。据介绍，作为市校融合发展的重要项目之一，东南大学与南京江北新区于2019年2月15日签署协议，合作建设中大医院新院区。项目位于江北新区生物医药谷，坐拥龙王山，总建筑面积50万平方米，总设置床位2500张，项目总投资约60亿元，计划2023年投入使用。新院区建成后将作为中大医院的主院区，依托国家级江北新区建设成为国家级区域医学中心，建设成为国家级医学交流与合作中心。江北院区发展再升级，2020年10月28日，南京江北新区妇女儿童健康中心—中大医院江北院区（扩建）开工仪式正式奠基开工，为江北新区的医疗卫生事业作出更大的贡献。
中大医院在复旦版2019年度百强医院排行榜中晋升三位，位列52位。重症医学科首次夺冠，荣登状元；放射科位列全国第八强；肾内科跻身全国十强。
2020年，中大医院在中国医院科技量值排行榜中，重症医学科排名第三、肾脏病学全国第七；重症医学科邱海波教授作为首席科学家荣获国家重点研发计划“新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急项目”专项资助；重症医学科杨毅教授荣获国家重大科技专项“重大新药创制项目”资助；重症医学科刘玲教授荣获华夏医学科技奖三等奖；肾内科刘必成教授荣获国家自然科学基金重点项目资助；放射科居胜红教授、介入与血管外科郭金和教授、重症医学科刘玲教授、妇产科沈杨教授、康复科王红星教授荣获5项江苏省重点研发计划（社会发展）项目；心理精神科袁勇贵教授荣获高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）二等奖；内分泌科孙子林教授和心血管内科陆文彬主治医师分别荣获江苏省科学技术奖二等奖和三等奖；泌尿外科陈明教授半岛BOB、重症医学科黄英姿教授、普外科陶庆松教授等团队的3项成果荣获江苏省医学新技术引进一等奖。
教育教学工作不断取得新进展、新成果。中大医院荣获2020年全国住院医师规范化培训“优秀培训基地负责人”荣誉称号；全科医学专业基地被评为住院医师规范化培训重点专业基地等荣誉。
中大医院神经外科、检验科、医学心理科、康复医学科、超声医学科新申报为省级临床重点专科，妇产科、老年医学科、药学部由建设单位转为省级临床重点专科。截至目前，中大医院省级临床重点专科增至27个。中大医院眼科、耳鼻咽喉-头颈外科、康复医学科、皮肤科、儿科五个专业顺利通过江苏省药监局对机构备案专业的现场督查检查。至此，中大医院能够承担药物临床试验的科室已由20个增至25个，基本实现临床药研方向的全覆盖。
医院派出多位专家前往云南省南华县、陕西省米脂县对口进行健康扶贫，通过技术扶持、捐赠物资、销售南华县农特产品等多种方式进行帮扶。此外，第九批中央和国家机关、中央企业援疆干部人才，妇产科林奇志主任医师及中央和国家机关、中央企业第九批援疆干部、肾内科王凤梅博士圆满完成援疆任务，被授予记功奖励半岛BOB。重症医学科潘纯主任医师作为中组部第19、20批赴青博士团成员，担任青海大学附属医院院长助理，帮扶青海重症医学科发展。
医联体建设稳步推进，67家集团医院合作成效显著，45个专家工作站（室）及专科诊疗分中心落户基层，7个专科（病）联盟成立或扩容，南京都市圈医联体建设不断推进，与郎溪县人民政府合作共建郎溪县人民医院。“中大模式”医联体内涵建设进一步强化，不断创新医联体合作形式，签署了关于进一步深化紧密型合作推动南京市溧水区人民医院高质量发展的补充协议，与溧水区院府新一轮合作正式启动。
自2018年10月20日在泌尿外科开展第一例达芬奇手术以来，达芬奇手术机器人在泌尿外科、妇产科、普外科等多个领域广泛应用，其中泌尿外科成功开展达芬奇机器人手术超千例，“达芬奇手术机器人”中国泌尿外科临床手术教学示范中心正式落户中大医院。
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